More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2797 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  65.75 
 
 
145 aa  197  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  36.72 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  38.71 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  39.82 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  38.68 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  39 
 
 
704 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
609 aa  77.4  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  42.71 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  36.04 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  40 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  35.04 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.33 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.61 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  37.96 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.34 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  32.58 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  39.77 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  42.2 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.36 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
625 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  36.29 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  30.63 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.9 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  40.19 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  33.05 
 
 
443 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  40.4 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.36 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  31.48 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  37.27 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  28.83 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  32.38 
 
 
666 aa  67  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.61 
 
 
603 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  30.83 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.47 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.19 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.33 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  38.18 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.17 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  35.77 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.17 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.54 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28 
 
 
660 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  30.09 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  31.93 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.61 
 
 
603 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.61 
 
 
603 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  31.62 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  35.14 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  34.51 
 
 
614 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
618 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 
623 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  35.19 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 
315 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
624 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  34.95 
 
 
152 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  33.64 
 
 
606 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  30 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
606 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.43 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  32.73 
 
 
606 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  32.76 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 
615 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  31.62 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  30.25 
 
 
611 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
641 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  29.13 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  31.03 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  35.64 
 
 
333 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  30.84 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.54 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  31.58 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  32.43 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  31.71 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  27.97 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  27.97 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  27.41 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  27.97 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  39.36 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  33 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.46 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>