More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2722 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  57.68 
 
 		 740 aa  816    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  100 
 
 		 730 aa  1483    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  41.85 
 
 		 700 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  39.6 
 
 		 705 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  42.03 
 
 		 699 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  40.85 
 
 		 753 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  39.76 
 
 		 726 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  37.11 
 
 		 720 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  38.33 
 
 		 750 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  37.48 
 
 		 731 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  37.28 
 
 		 731 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  37.14 
 
 		 739 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  39.53 
 
 		 725 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  36.32 
 
 		 743 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  37.46 
 
 		 724 aa  425  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  36.84 
 
 		 741 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  37.46 
 
 		 724 aa  425  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  38.45 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  36.59 
 
 		 728 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  36.3 
 
 		 706 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  40.43 
 
 		 728 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.53 
 
 		 865 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  35.46 
 
 		 892 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  37.12 
 
 		 1003 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.57 
 
 		 739 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.57 
 
 		 1012 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  36.52 
 
 		 712 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38 
 
 		 1024 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.17 
 
 		 1008 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.17 
 
 		 1008 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  36.66 
 
 		 726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.98 
 
 		 1013 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  34.64 
 
 		 714 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  37.27 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.05 
 
 		 1016 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  34.93 
 
 		 714 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.94 
 
 		 1001 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  38.68 
 
 		 721 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  36.21 
 
 		 980 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.18 
 
 		 717 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  37.88 
 
 		 976 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  36.7 
 
 		 930 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  37.01 
 
 		 971 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 1000 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  36.02 
 
 		 906 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.55 
 
 		 1019 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  31.08 
 
 		 968 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  38.92 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  36.02 
 
 		 906 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.89 
 
 		 1038 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.89 
 
 		 1038 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  37.73 
 
 		 712 aa  369  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  36.4 
 
 		 986 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  37.88 
 
 		 975 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  37.55 
 
 		 712 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  37.55 
 
 		 712 aa  364  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 1006 aa  363  7.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.79 
 
 		 999 aa  360  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  33.82 
 
 		 740 aa  360  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.17 
 
 		 908 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  37.43 
 
 		 523 aa  359  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  35.51 
 
 		 908 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  35.09 
 
 		 982 aa  353  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  35.55 
 
 		 719 aa  350  5e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  34.93 
 
 		 724 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  34.54 
 
 		 724 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.86 
 
 		 1013 aa  341  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  38.53 
 
 		 715 aa  340  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  35.7 
 
 		 1011 aa  339  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.36 
 
 		 715 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.53 
 
 		 1018 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.58 
 
 		 1040 aa  333  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  33.99 
 
 		 1018 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.73 
 
 		 1018 aa  328  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  33.73 
 
 		 744 aa  320  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.85 
 
 		 736 aa  319  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.06 
 
 		 1042 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 		 744 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  32.53 
 
 		 721 aa  310  6.999999999999999e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  30.85 
 
 		 741 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  29.12 
 
 		 742 aa  296  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  29.09 
 
 		 770 aa  296  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  30.5 
 
 		 767 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.85 
 
 		 717 aa  293  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.13 
 
 		 727 aa  293  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  30.69 
 
 		 704 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.02 
 
 		 731 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.49 
 
 		 759 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  29.6 
 
 		 718 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  29.92 
 
 		 723 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  32.95 
 
 		 726 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  30.1 
 
 		 704 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  29.99 
 
 		 776 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  32.63 
 
 		 721 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  28.86 
 
 		 734 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  28.62 
 
 		 762 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.98 
 
 		 738 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  28.37 
 
 		 712 aa  283  8.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  27.84 
 
 		 737 aa  282  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>