127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2651 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2651  septum formation initiator  100 
 
 
99 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3185  cell division protein FtsB  70.33 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.389841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1182  septum formation initiator  62.03 
 
 
80 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.539274  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1321  cell division protein FtsB  59.72 
 
 
92 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0911  Septum formation initiator  62.22 
 
 
94 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1895  cell division protein FtsB  47.83 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0996  cell division protein FtsB  62.22 
 
 
94 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3447  Septum formation initiator  60.56 
 
 
92 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1688  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000947762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2710  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2192  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0728748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3126  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.679359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2576  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2630  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1465  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2848  cell division protein FtsB  64.38 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460691  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1173  septum formation initiator  53.42 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.41848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5109  septum formation initiator  61.76 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.771169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5412  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5971  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2106  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2124  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199661  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2143  cell division protein FtsB  44.57 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2649  septum formation initiator  64.44 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2016  cell division protein FtsB  44.57 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1908  cell division protein FtsB  43.18 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.46013  normal  0.669467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2363  cell division protein FtsB  43.02 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.685194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1229  septum formation initiator  48.61 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1164  cell division protein FtsB  48 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2559  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238531  normal  0.205599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1574  cell division protein FtsB  46.74 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0501126  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1092  cell division protein FtsB  47.37 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1056  cell division protein FtsB  47.37 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1438  cell division protein FtsB  44.87 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0719593  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1664  Septum formation initiator  50.72 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3856  septum formation initiator  39.53 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0137964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1291  septum formation initiator  45 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000132598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1069  cell division protein FtsB  42.31 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0318895  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0973  cell division protein FtsB  42.31 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108373  normal  0.0382578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1130  cell division protein FtsB  43.59 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1364  septum formation initiator  53.52 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1869  septum formation initiator  39.53 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000425121  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1663  septum formation initiator  40.74 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000362225  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1186  septum formation initiator  45 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002509  cell division protein FtsB  33.72 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000404071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1555  hypothetical protein  53.52 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.735707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1246  cell division protein FtsB  38.55 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0420044  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0948  septum formation initiator  36.05 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1187  cell division protein FtsB  43.21 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0200308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1117  cell division protein FtsB  43.21 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1238  Septum formation initiator  40.7 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00877838  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3126  septum formation initiator  40.7 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.161431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3135  septum formation initiator  40.7 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03524  cell division protein FtsB  32.58 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1185  Septum formation initiator  42.86 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3278  septum formation initiator  40.7 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1453  cell division protein FtsB  44.29 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1495  cell division protein FtsB  32.18 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0328  cell division protein  42.86 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1864  cell division protein ftsB  42.86 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1116  cell division protein FtsB  41.98 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372931  normal  0.865304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2021  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2016  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0896  Septum formation initiator  34.88 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1635  cell division protein FtsB  39.53 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  9.0689e-17  hitchhiker  0.000571859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0622  cell division protein FtsB  38.46 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2756  septum formation initiator  39.08 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0850  septum formation initiator family protein  41.86 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1071  septum formation initiator family protein  41.86 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3439  hypothetical protein  40.74 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1122  cell division protein FtsB  47.89 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0997636  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0976  Septum formation initiator  41.86 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0407513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2639  cell division protein FtsB  38.96 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0671  septum formation initiator  33.33 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0137843  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1206  septum formation initiator  40.74 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000148323  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17330  hypothetical protein  41.57 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3032  cell division protein FtsB  46.67 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528115  hitchhiker  0.0020798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1505  hypothetical protein  41.57 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3300  cell division protein FtsB  37.18 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0965  cell division protein FtsB  37.18 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3432  cell division protein FtsB  37.18 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4062  septum formation initiator  48.57 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2513  cell division protein FtsB homolog  33.71 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.77414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3219  cell division protein FtsB  35.06 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0922  septum formation initiator  41.43 
 
 
90 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1613  septum formation initiator  47.14 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.913792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4164  septum formation initiator  47.14 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.719866  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1167  septum formation initiator  47.14 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.660298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38780  cell division protein-Septum formation initiator  48.48 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00170  cell division protein FtsB  40 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0825  cell division protein FtsB  35.9 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.299697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0569  cell division protein FtsB  40 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0617  cell division protein FtsB  40 
 
 
118 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.740532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3349  septum formation initiator  44.29 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000140943  hitchhiker  0.00000175822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3121  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1838  cell division protein FtsB  44.19 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0739072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3056  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3241  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3082  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3137  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.0827002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>