283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2614 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  68.72 
 
 		 210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  68.25 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  68.25 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  67.3 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  67.3 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  67.3 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  67.3 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  67.3 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  67.77 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  67.3 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  67.3 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  67.3 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  67.3 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  66.82 
 
 		 210 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  68.57 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  67.3 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  66.35 
 
 		 210 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  65.88 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  67.3 
 
 		 212 aa  297  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  66.82 
 
 		 212 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  64.93 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  65.71 
 
 		 211 aa  294  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  64.45 
 
 		 211 aa  287  9e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  64.93 
 
 		 212 aa  287  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  62.86 
 
 		 211 aa  278  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  63.51 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  60.77 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  60.95 
 
 		 210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  59.53 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  61.61 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  59.52 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  59.05 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  59.05 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  60 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  59.72 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  60.09 
 
 		 212 aa  264  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  59.62 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  63.03 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  58.85 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  58.1 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  58.1 
 
 		 210 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  61.14 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  57.35 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  61.61 
 
 		 210 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  60.19 
 
 		 212 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  58.29 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  56.19 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  58.29 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  52.53 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  58.85 
 
 		 210 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  62.68 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  60 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  56.22 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  55.08 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  56.81 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  53.02 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  59.05 
 
 		 210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  55.92 
 
 		 209 aa  244  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  58.29 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  56.35 
 
 		 198 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  57.87 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  53.37 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  58.41 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  52.44 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  41 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.33 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  34.67 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  34.12 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  35.62 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  36.87 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  34.88 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.02 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.42 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  32.42 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 223 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  34.48 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  29.31 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  34.05 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  31.16 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  32.48 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  32.33 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>