More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2606 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 395 aa  805    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  73.16 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  74.43 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  72.98 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  72.98 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  72.47 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  72.98 
 
 		 398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  57.61 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  57.36 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  57.11 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  43.77 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  47.55 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  46.91 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  44.53 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  45.1 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  44.44 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  44.19 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  44.99 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  43.83 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 398 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  42.82 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  46.33 
 
 		 402 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  44.36 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  44.36 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  39.13 
 
 		 398 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  44.11 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  40.46 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  40.46 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  43.59 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  41.3 
 
 		 426 aa  289  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  39.14 
 
 		 394 aa  289  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  40.46 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  44.13 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.85 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.85 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  40.46 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  40.46 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  40.46 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  40.46 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  40.46 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  40.46 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 405 aa  280  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 394 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.13 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.77 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.35 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 463 aa  269  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.71 
 
 		 420 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  40.81 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 395 aa  265  8e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 340 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.91 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>