126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2526 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  72.95 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  71.89 
 
 		 283 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  72.04 
 
 		 282 aa  410  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  69.64 
 
 		 283 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  68.1 
 
 		 283 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  67.73 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  66.67 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  57.4 
 
 		 289 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  54.21 
 
 		 281 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  51.45 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  50.72 
 
 		 282 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  49.44 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  49.07 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  49.07 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  48.89 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  48.52 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  49.82 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  48.15 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  44.78 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  48.59 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  50.18 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  50.18 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  50.18 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  49.46 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  50.18 
 
 		 280 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  50.55 
 
 		 280 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  48.9 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  48.9 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  48.9 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  48.9 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  48.9 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  48.9 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1473  hypothetical protein  47.69 
 
 		 218 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.797183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  34.94 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  32.48 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  32.48 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  30.8 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  34.36 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 281 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  34.42 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2745  hypothetical protein  38.2 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  31.37 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2651  hypothetical protein  39.53 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  34.66 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  35.23 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1215  hypothetical protein  37.78 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00122571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  36.11 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0042  hypothetical protein  34.24 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00533467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2554  hypothetical protein  34.2 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11238  normal  0.887248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2055  hypothetical protein  29.33 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6509  predicted protein  31.94 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236184  normal  0.418162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0499  hypothetical protein  30.37 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.623817  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0284  hypothetical protein  32.76 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  0.168748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0176  hypothetical protein  28.93 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.244166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0753  hypothetical protein  27.07 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  23.72 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5838  hypothetical protein  28.73 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4618  hypothetical protein  30.45 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0820  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  26.82 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4478  hypothetical protein  30.45 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4602  hypothetical protein  28.35 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  27.89 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  26.64 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  25.29 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2893  hypothetical protein  23.33 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1191  hypothetical protein  28 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1027  hypothetical protein  28.16 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19860  hypothetical protein  26.77 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3860  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493821  normal  0.355777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1707  hypothetical protein  27.52 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3588  hypothetical protein  26.2 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0914  hypothetical protein  29.92 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  24.55 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43473  predicted protein  28.26 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0869  putative transcritional regulator  36.47 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2559  hypothetical protein  25.1 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.026679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3249  hypothetical protein  29.58 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10750  hypothetical protein  28.77 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>