255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2492 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  73.83 
 
 		 149 aa  223  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  67.81 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  64.54 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  63.76 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  68.25 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  63.08 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  64 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  61.19 
 
 		 137 aa  163  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  63.08 
 
 		 154 aa  159  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  52.82 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  53.28 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  49.23 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  49.59 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  46.97 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  48.78 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  48.78 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  48.78 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  48.78 
 
 		 159 aa  119  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  47.97 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  49.22 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  48.44 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  40.65 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  37.07 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  38.52 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  40.86 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  40.86 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.52 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.9 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  35.29 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 232 aa  57  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  31.09 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  34 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.97 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  28.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  32.43 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5298  phenylacetic acid degradation-related protein  31.5 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>