More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2470 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  78.02 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  76.58 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  71.43 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  71.43 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  67.91 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  67.16 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  64.55 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  66.17 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  64.31 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  56.18 
 
 		 273 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  63.81 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  54.28 
 
 		 303 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  55.21 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  53.9 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  55.19 
 
 		 301 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  58.15 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  55.05 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  52.24 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  51.66 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  64.68 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 267 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  53.36 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  46.95 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  48.76 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  52.4 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 497 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  47.95 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  45.95 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 		 269 aa  216  5e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  49.81 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 268 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 267 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  45.72 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 497 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 		 436 aa  208  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.41 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.41 
 
 		 270 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>