More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2447 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  100 
 
 
397 aa  781  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  77.08 
 
 
390 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  76.2 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  78.5 
 
 
390 aa  577  1e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  74.17 
 
 
392 aa  575  1e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  79.51 
 
 
390 aa  572  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  73.91 
 
 
392 aa  572  1e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  77.1 
 
 
401 aa  573  1e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  75.44 
 
 
396 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  75.45 
 
 
394 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  75.44 
 
 
396 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  75.44 
 
 
396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  79.74 
 
 
401 aa  563  1e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  78.16 
 
 
401 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  76.49 
 
 
390 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  76.49 
 
 
390 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  76.23 
 
 
390 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  69.82 
 
 
398 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  67.45 
 
 
385 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  68.54 
 
 
399 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  70.91 
 
 
400 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  61.9 
 
 
393 aa  459  1e-128  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.31 
 
 
382 aa  461  1e-128  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.22 
 
 
395 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.27 
 
 
392 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  77.49 
 
 
188 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  77.49 
 
 
188 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  78.69 
 
 
187 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  78.69 
 
 
187 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.62 
 
 
379 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.14 
 
 
393 aa  191  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  35.29 
 
 
383 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.22 
 
 
382 aa  185  1e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.77 
 
 
387 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.19 
 
 
387 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  30.95 
 
 
376 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.34 
 
 
404 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.59 
 
 
389 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  29.42 
 
 
453 aa  167  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  32.89 
 
 
376 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.05 
 
 
393 aa  165  1e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.53 
 
 
442 aa  165  2e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.49 
 
 
386 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.02 
 
 
391 aa  162  8e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  28.53 
 
 
455 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  29.45 
 
 
456 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.29 
 
 
388 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.32 
 
 
450 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.04 
 
 
456 aa  157  5e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  30.29 
 
 
446 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  30.92 
 
 
376 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.53 
 
 
457 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.72 
 
 
454 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  31.3 
 
 
450 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  31.11 
 
 
456 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  31.82 
 
 
450 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  29.61 
 
 
456 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  30.6 
 
 
447 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  29.11 
 
 
445 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  29.68 
 
 
444 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  29.29 
 
 
453 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.54 
 
 
452 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.46 
 
 
428 aa  142  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.46 
 
 
454 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.4 
 
 
447 aa  140  4e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  26.85 
 
 
408 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.12 
 
 
417 aa  137  3e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  30.21 
 
 
428 aa  137  3e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  26.11 
 
 
408 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.89 
 
 
483 aa  136  6e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  25.83 
 
 
463 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  26.72 
 
 
466 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.26 
 
 
420 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.49 
 
 
443 aa  134  4e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.06 
 
 
418 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.79 
 
 
467 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  30.26 
 
 
463 aa  132  8e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  26.52 
 
 
467 aa  128  1e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  27.11 
 
 
469 aa  128  2e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  31.01 
 
 
450 aa  128  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.44 
 
 
471 aa  127  4e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  27.45 
 
 
443 aa  127  4e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.06 
 
 
395 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.54 
 
 
469 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.61 
 
 
441 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.15 
 
 
469 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.65 
 
 
469 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.21 
 
 
352 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.15 
 
 
469 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  23.74 
 
 
416 aa  122  1e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.03 
 
 
473 aa  121  2e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  25.55 
 
 
466 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  27.14 
 
 
454 aa  120  4e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  27.14 
 
 
454 aa  120  4e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.63 
 
 
473 aa  119  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  29.45 
 
 
358 aa  118  2e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.59 
 
 
441 aa  114  2e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  24.93 
 
 
462 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.12 
 
 
460 aa  114  2e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  25.11 
 
 
461 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>