87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2446 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  100 
 
 		 316 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  56.91 
 
 		 306 aa  353  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  51.91 
 
 		 313 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  51.91 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  52.58 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  51.48 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  47.34 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  46.62 
 
 		 325 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  47.73 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  46.86 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  46.86 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  46.86 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  46.86 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  42.86 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  42.86 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  46.36 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  46.36 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  41.94 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  42.86 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  42.86 
 
 		 320 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  43.69 
 
 		 320 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  42.21 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  44.48 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  41.04 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  41.04 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  41.04 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  40.58 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  45.42 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  44.49 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.43 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  28.53 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  29.55 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  35 
 
 		 141 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.59 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  36.09 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  38.3 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  34.01 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  34.56 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  29.23 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  32.16 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  32.16 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  32.82 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  31.3 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  31.85 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  27.86 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  29.01 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  35.46 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  34.35 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  28.29 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  30 
 
 		 142 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  29.75 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  34.53 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  27.94 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  26.72 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  30.82 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  30.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  28.83 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  28.22 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5227  chromate resistance signal  58.14 
 
 		 53 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  26.47 
 
 		 155 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  27.5 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  24.05 
 
 		 172 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  35.38 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  24.68 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>