43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2413 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  63.75 
 
 		 244 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  59.69 
 
 		 264 aa  281  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  62.85 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  63.24 
 
 		 256 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  58.51 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  52.73 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  36.21 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  34 
 
 		 322 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  33.9 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  33.07 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  34.57 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  33.05 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  101  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  30.2 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  33.88 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  28.02 
 
 		 329 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  29.6 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  34.69 
 
 		 328 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  34.84 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  30.12 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  31.78 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.31 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  26.64 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  27.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  28.4 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  22.86 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  34.55 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  25.59 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  27.46 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  23.27 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  22.86 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  33.73 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  27.55 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  25.1 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  23.33 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  25.82 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  24.12 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  25.4 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>