202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2375 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  92.86 
 
 		 140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  87.86 
 
 		 140 aa  253  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  87.86 
 
 		 140 aa  253  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  87.86 
 
 		 140 aa  253  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  86.43 
 
 		 140 aa  251  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  85.71 
 
 		 140 aa  251  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  86.43 
 
 		 140 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  247  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  85 
 
 		 140 aa  246  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  84.29 
 
 		 140 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  86.13 
 
 		 139 aa  242  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  86.86 
 
 		 168 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  83.94 
 
 		 139 aa  239  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  85.61 
 
 		 139 aa  235  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  83.94 
 
 		 139 aa  233  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  82.22 
 
 		 139 aa  228  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  79.71 
 
 		 140 aa  223  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  76.3 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  77.78 
 
 		 139 aa  214  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  77.78 
 
 		 139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  77.78 
 
 		 139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  76.09 
 
 		 139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  66.91 
 
 		 146 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  68.15 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  64.93 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  61.31 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  58.57 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  54.2 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  53.12 
 
 		 164 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  53.03 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  52.86 
 
 		 179 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  50.39 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  47.41 
 
 		 178 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  52.71 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  52.34 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  50 
 
 		 168 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  50 
 
 		 178 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  49.29 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  50.38 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  50 
 
 		 165 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  47.14 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  49.23 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  45.77 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  50.39 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  47.69 
 
 		 177 aa  110  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  47.52 
 
 		 191 aa  110  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  45.14 
 
 		 192 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  47.86 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  50 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  45.19 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  45.99 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  46.97 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  48.06 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  46.97 
 
 		 166 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  45.99 
 
 		 190 aa  105  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  46.21 
 
 		 166 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  46.92 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  44.12 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  48.82 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  42.07 
 
 		 191 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  44.93 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  46.56 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  44.12 
 
 		 191 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  41.96 
 
 		 197 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  44.62 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  43.07 
 
 		 191 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  47.24 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  43.8 
 
 		 191 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  46.09 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  45.38 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  42.42 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  43.7 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  43.88 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  46.09 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  44.06 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  44.2 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  45.93 
 
 		 221 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  42.57 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  50 
 
 		 169 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  47.06 
 
 		 179 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  45.31 
 
 		 166 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  44.09 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  43.88 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.18 
 
 		 233 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  44.7 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  45.67 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  47.24 
 
 		 166 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  44.62 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  44.2 
 
 		 177 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  43.85 
 
 		 166 aa  97.1  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1762  rubrerythrin  43.31 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  39.86 
 
 		 191 aa  97.1  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>