More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2032 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
505 aa  1022    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  70.83 
 
 
499 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  68.39 
 
 
520 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  64.38 
 
 
506 aa  631  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  63.75 
 
 
493 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  63.75 
 
 
493 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1294  Ppx/GppA phosphatase  62.97 
 
 
520 aa  599  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  61.08 
 
 
506 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  52.49 
 
 
494 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  47.81 
 
 
512 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  44.2 
 
 
526 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3600  Ppx/GppA phosphatase  47.41 
 
 
514 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  43.58 
 
 
499 aa  359  6e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  41.54 
 
 
504 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  42.37 
 
 
504 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  42.25 
 
 
491 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  41 
 
 
504 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  41.46 
 
 
512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  40.88 
 
 
499 aa  343  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  41.48 
 
 
535 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  40.55 
 
 
504 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  40.8 
 
 
504 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  40.76 
 
 
504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  40.76 
 
 
504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  40.76 
 
 
504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  40.7 
 
 
509 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  39.8 
 
 
506 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  40.76 
 
 
504 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  40.75 
 
 
503 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  40.71 
 
 
501 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  40.95 
 
 
510 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  38.6 
 
 
501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  40.34 
 
 
526 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  38.65 
 
 
508 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  39.71 
 
 
500 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  40.16 
 
 
507 aa  322  7e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  39.24 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  39.6 
 
 
527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  39.92 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  44.07 
 
 
500 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  38.61 
 
 
500 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  38.82 
 
 
500 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  39.41 
 
 
512 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  39.21 
 
 
512 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  38.48 
 
 
500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  39.62 
 
 
500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  38.3 
 
 
520 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  41.21 
 
 
497 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  40.47 
 
 
500 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  39.63 
 
 
505 aa  300  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  40.51 
 
 
477 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  40.82 
 
 
509 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  38.02 
 
 
499 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  37.32 
 
 
513 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  40.14 
 
 
508 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  40.14 
 
 
499 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  38.03 
 
 
526 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  38.39 
 
 
505 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  38.03 
 
 
526 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  38.03 
 
 
526 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  38.03 
 
 
526 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  38.03 
 
 
513 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 
502 aa  289  8e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  37.64 
 
 
500 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  39.1 
 
 
508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  35.09 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  34.85 
 
 
509 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  38.97 
 
 
506 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  35.42 
 
 
501 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  41.22 
 
 
501 aa  279  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  37.58 
 
 
513 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  38.86 
 
 
511 aa  279  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  37.36 
 
 
513 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  34.25 
 
 
501 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  38.86 
 
 
511 aa  279  9e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  35.11 
 
 
501 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  38.86 
 
 
508 aa  277  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  36.22 
 
 
511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  36.29 
 
 
516 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.9 
 
 
497 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  36.87 
 
 
500 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  35.78 
 
 
511 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  37.98 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  38.62 
 
 
503 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  38.62 
 
 
503 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  35.71 
 
 
519 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  35.71 
 
 
519 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>