156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1985 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  100 
 
 		 295 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  63.61 
 
 		 295 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  41.11 
 
 		 603 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  39.7 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 320 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  40.15 
 
 		 607 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  38.59 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  38.46 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  37.83 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  36.7 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  36.3 
 
 		 275 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  33.22 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.32 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  35.36 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  30.77 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  35.85 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  34.2 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  34.27 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  31.54 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  31.21 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  27.14 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  34.31 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  35.14 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  28.47 
 
 		 301 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  31.51 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.22 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.48 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  24.78 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.41 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  25.57 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.02 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.49 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 		 554 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  29.24 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  22.66 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.25 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  23.42 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  21.38 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.56 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  27.18 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  23.18 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  21.94 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  21.94 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  24.31 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  21.97 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  21.95 
 
 		 255 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 		 244 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.54 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.74 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  25.54 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.99 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  24.64 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  22.3 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  22.3 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>