292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1906 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 351 aa  712    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  63.66 
 
 		 358 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  63.27 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  62.9 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  62.9 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  63.56 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  37.46 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  39.19 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  37.39 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  37.11 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  34.9 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  35.61 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  35.63 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  35.34 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.65 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  34.2 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  33.13 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  35.51 
 
 		 344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.88 
 
 		 843 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  32.24 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  32.24 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  34.21 
 
 		 320 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  29.75 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.9 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  29.75 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  30.23 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  27.44 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.91 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  28.9 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  26.42 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  30.18 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  26.24 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  27.92 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  27.46 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.97 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  45.31 
 
 		 670 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  43.75 
 
 		 670 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  51.16 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  51.16 
 
 		 647 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  54.35 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  52.38 
 
 		 645 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  46.15 
 
 		 792 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  46.3 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  31.9 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  44.29 
 
 		 532 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  31.31 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  48 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  39.34 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  31.31 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.61 
 
 		 523 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  48 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 510 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.36 
 
 		 438 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  51.16 
 
 		 573 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  22.72 
 
 		 484 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.14 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  48.84 
 
 		 647 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  46.94 
 
 		 523 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  44.44 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  40 
 
 		 667 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  41.1 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  40 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.67 
 
 		 677 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.810441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  41.1 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3639  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.67 
 
 		 677 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.664149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  40.3 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  40.3 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  40.3 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  39.73 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  40.3 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  40.3 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  36 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  40.3 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>