216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1865 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  68.28 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  29.94 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  28.25 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.75 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  31.49 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  30.22 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  31.67 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  28.98 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.85 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  30.89 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.26 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  31.84 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  33.15 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  30.69 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  31.25 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  27.42 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  26.18 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  26.82 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  30.56 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  25 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  26.06 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  27.42 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  26.88 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  27.57 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  27.57 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  27.07 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  31.18 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  32.6 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  32.07 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  26.7 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  25.68 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  30 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  31.11 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  26.86 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  29.28 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  27.62 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  28.41 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  25.53 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.95 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  26.29 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  29.44 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  28.72 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  28.26 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  28.19 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  28.72 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  28.72 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  27.68 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  27.57 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  26.52 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  27.27 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  28.81 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  26.2 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  46.97 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  46.97 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  26.92 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  25.53 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  47.83 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  43.08 
 
 		 81 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  41.54 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.47 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.47 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  40.91 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  25.99 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.62 
 
 		 76 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.54 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  40.91 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  43.48 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  43.48 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.08 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  43.08 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  43.08 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  43.08 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  43.08 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  33.6 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  27.34 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  46.48 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.61 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.71 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.55 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  41.54 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  40.79 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.03 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.1 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.34 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  39.66 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  26.84 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  39.66 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.68 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  39.66 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  39.47 
 
 		 323 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  30 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  39.47 
 
 		 323 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  39.47 
 
 		 323 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  36.36 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>