More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1756 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 405 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  49.02 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 415 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  40.55 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  40.55 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  40.81 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  40.3 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  40.3 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  40.3 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  40.3 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  36.34 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  36.18 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 410 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  35.01 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  36.72 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  37.44 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  39.45 
 
 		 493 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  36.9 
 
 		 461 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 445 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  32.5 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 432 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 417 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  29.3 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  29.01 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.97 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  27.08 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.73 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  27.37 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  27.37 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25.31 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  25.31 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  29.04 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.72 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.37 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.87 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  23.61 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  27.91 
 
 		 452 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  27.91 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  28.31 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  28 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  25.14 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  30 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.01 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  26.53 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25.64 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>