37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1695 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  82.26 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  66.13 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  76.67 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  80 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  58.33 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  55.93 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.25 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  54.24 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  58.33 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  52.38 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.39 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.06 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  46.77 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  43.86 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.06 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  48.28 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.93 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  60 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  53.33 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  40 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  57.58 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  46.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  46.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  57.58 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  42.86 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  75 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  50 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  45.45 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  36.92 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  44.19 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  44.19 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>