More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1667 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  100 
 
 
166 aa  341  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  82.93 
 
 
167 aa  282  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  84.34 
 
 
167 aa  279  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  84.15 
 
 
167 aa  279  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1803  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  81.48 
 
 
171 aa  274  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  70.7 
 
 
165 aa  236  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  70.7 
 
 
165 aa  236  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  66.25 
 
 
166 aa  231  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.74 
 
 
167 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.74 
 
 
167 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.67 
 
 
168 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3224  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.88 
 
 
166 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.96 
 
 
165 aa  222  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.03 
 
 
161 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.81 
 
 
161 aa  221  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4138  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.78 
 
 
171 aa  221  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.96 
 
 
165 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2807  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.96 
 
 
165 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.96 
 
 
165 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.35 
 
 
166 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.35 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.52 
 
 
171 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.35 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.35 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0310  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.73 
 
 
168 aa  217  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426352  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.69 
 
 
160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.25 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.62 
 
 
165 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.04 
 
 
183 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.04 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.04 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.9 
 
 
165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.09 
 
 
160 aa  198  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.04 
 
 
159 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.87 
 
 
161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.39 
 
 
159 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  59.09 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.71 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.09 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.5 
 
 
162 aa  193  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.07 
 
 
159 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.86 
 
 
170 aa  192  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.97 
 
 
163 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  57.96 
 
 
170 aa  191  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.44 
 
 
164 aa  191  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  56.69 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  56.13 
 
 
159 aa  187  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.58 
 
 
160 aa  187  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.06 
 
 
160 aa  187  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.52 
 
 
160 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.6 
 
 
164 aa  184  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.41 
 
 
174 aa  183  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.13 
 
 
162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  55.77 
 
 
169 aa  182  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  53.7 
 
 
164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0895  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  56.41 
 
 
173 aa  180  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933581  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.26 
 
 
159 aa  180  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  55.41 
 
 
181 aa  180  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.76 
 
 
168 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.55 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1282  coenzyme A biosynthesis protein  59.31 
 
 
172 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.23 
 
 
162 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.5 
 
 
163 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.5 
 
 
163 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.5 
 
 
163 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.87 
 
 
158 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.3 
 
 
159 aa  175  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
158 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0298  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.17 
 
 
159 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49145  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.5 
 
 
163 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.87 
 
 
162 aa  173  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.5 
 
 
168 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.03 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.92 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.61 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
159 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.36 
 
 
163 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
159 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
159 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
159 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.36 
 
 
163 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.23 
 
 
168 aa  171  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.27 
 
 
159 aa  171  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.3 
 
 
161 aa  170  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>