More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1513 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  63.91 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 164 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  45.77 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  40.97 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 180 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.16 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  37.84 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  38.3 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 145 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  39.16 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 145 aa  84.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  38.76 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  37.98 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.6 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  36.7 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>