58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1455 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  100 
 
 		 153 aa  323  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2023  cytochrome c prime  42.64 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3015  cytochrome c, class II  41.22 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.628177  normal  0.504757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  31.33 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  29.2 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5272  cytochrome c, class II  31.51 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  28.23 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5019  cytochrome c'  29.1 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07030  putative cytochrome c'  33.8 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0644  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4843  cytochrome c, class II  28.57 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  29.86 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  31.97 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4970  cytochrome c', putative  28.03 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  29.84 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  35.29 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  27.64 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03580  cytochrome C  30.56 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0385574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  28.12 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  31.86 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  28.46 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  29.7 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  27.34 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  30.34 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  23.49 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  23.45 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  24.79 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  24.5 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  23.93 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  25.2 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  24.14 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  24.14 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  25.69 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0408  cytochrome c, class II  26.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  29.03 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  23.45 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  23.45 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  27.87 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  22.5 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  23.08 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  26.02 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  23.08 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  23.08 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  23.08 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  22.22 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  25.34 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  22.22 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  24.49 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  24 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  24.67 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  23.03 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  25.4 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  25.66 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  33.9 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  25.81 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  25.81 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0569  cytochrome c, class II  31.25 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  25 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>