139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1451 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  100 
 
 		 277 aa  577  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  35.61 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  29.37 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  32.58 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  30.08 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  27.05 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  27.42 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.03 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  28.35 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  28.35 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  25.78 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  34.88 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 736 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  32.2 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  24.24 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.81 
 
 		 749 aa  55.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  29.93 
 
 		 667 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  29.27 
 
 		 131 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  28.68 
 
 		 134 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  27.2 
 
 		 529 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  35.16 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 131 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  29.6 
 
 		 130 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  28.12 
 
 		 138 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 133 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  29.17 
 
 		 165 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 131 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 		 518 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.1 
 
 		 146 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  24.03 
 
 		 147 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 529 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  24.81 
 
 		 140 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  27.73 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 941 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 		 529 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2732  hypothetical protein  27.56 
 
 		 137 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 134 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  25.4 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  25.4 
 
 		 188 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  25.19 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.13 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  26.23 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  28.93 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.78 
 
 		 145 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 		 165 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 		 165 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  26.05 
 
 		 146 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  25.19 
 
 		 138 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.35 
 
 		 133 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.19 
 
 		 526 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  29.23 
 
 		 149 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  26.83 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 		 529 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  27.73 
 
 		 134 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 927 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  26.32 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.88 
 
 		 768 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  26.98 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  23.2 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  24 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  27.42 
 
 		 631 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1871  hemerythrin-like metal-binding protein  27.74 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 129 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 		 147 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  24.22 
 
 		 143 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.39 
 
 		 529 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.39 
 
 		 529 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.39 
 
 		 529 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>