More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1429 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  83.64 
 
 		 344 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  82.1 
 
 		 328 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  79.76 
 
 		 331 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  81.29 
 
 		 328 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  80.06 
 
 		 328 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  78.72 
 
 		 330 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  75.77 
 
 		 327 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  76.4 
 
 		 326 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  72.95 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.6 
 
 		 322 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.96 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  61.77 
 
 		 324 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.55 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.86 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  58.95 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  60.06 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  58.51 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.13 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  59.44 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.33 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.44 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.64 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.75 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  57.36 
 
 		 325 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 		 327 aa  358  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.31 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  58.02 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  56.35 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  56.92 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 		 322 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.54 
 
 		 323 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 325 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  57.54 
 
 		 323 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  56.92 
 
 		 325 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 		 323 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 		 325 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.92 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56 
 
 		 325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  56.31 
 
 		 325 aa  351  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.56 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.7 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  56.17 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  53.35 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.66 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.35 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.74 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.17 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.77 
 
 		 326 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.13 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  51.22 
 
 		 326 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.39 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 		 321 aa  329  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.92 
 
 		 326 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.92 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.16 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.16 
 
 		 327 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.16 
 
 		 327 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.06 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.85 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.38 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 		 324 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.07 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.07 
 
 		 328 aa  318  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  51.38 
 
 		 325 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.46 
 
 		 323 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.85 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.54 
 
 		 329 aa  315  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.31 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 		 327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>