More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1402 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1402  ribosomal protein S16  100 
 
 		 83 aa  167  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3939  30S ribosomal protein S16  81.93 
 
 		 83 aa  145  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2703  30S ribosomal protein S16  80.72 
 
 		 83 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.457826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3355  30S ribosomal protein S16  80.72 
 
 		 83 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  79.52 
 
 		 83 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1473  ribosomal protein S16  84.42 
 
 		 87 aa  137  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  75.9 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  74.7 
 
 		 84 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  74.7 
 
 		 84 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1884  30S ribosomal protein S16  82.67 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1461  ribosomal protein S16  77.22 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  71.08 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  69.88 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5345  ribosomal protein S16  71.08 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  66.27 
 
 		 84 aa  123  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 84 aa  123  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  68.67 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  68.83 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0517  30S ribosomal protein S16  70.67 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1285  30S ribosomal protein S16  70.67 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.362311  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1104  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0681  30S ribosomal protein S16  62.65 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  60.98 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  62.67 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  53.01 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 83 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  54.22 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0647  ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 80 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0095  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02498  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0245657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3848  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000663881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02462  hypothetical protein  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2998  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00134476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2768  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0198  ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2893  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>