61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1361 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  67.53 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  65.38 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  69.44 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2832  phage transcriptional regulator, AlpA  48.65 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0794496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  33.77 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  50 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  52 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  38.67 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  48.98 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  43.48 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  39.29 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  36.23 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  44.68 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  40.43 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  37.5 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  38.6 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  36.96 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  46.3 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  32.81 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3885  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  48.57 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>