More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1329 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  75.85 
 
 
236 aa  370  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  73.62 
 
 
241 aa  355  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  73.82 
 
 
235 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  73.19 
 
 
237 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  70.76 
 
 
236 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  70.56 
 
 
264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  73.18 
 
 
237 aa  331  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  72.65 
 
 
238 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  72.65 
 
 
238 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  66.09 
 
 
237 aa  321  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  58.8 
 
 
279 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  58.14 
 
 
281 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  57.41 
 
 
279 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  57.41 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  56.68 
 
 
316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  56.68 
 
 
316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  56.68 
 
 
281 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  56.22 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  56.5 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  57.21 
 
 
316 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  55.56 
 
 
307 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
454 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
281 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
281 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
281 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
281 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
281 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
568 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  55.09 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  53.21 
 
 
281 aa  228  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  55.56 
 
 
279 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  52.75 
 
 
285 aa  218  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  52.56 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  52.09 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  53.27 
 
 
296 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  52.86 
 
 
296 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  49.09 
 
 
276 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
275 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
278 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  50.71 
 
 
404 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  47.25 
 
 
302 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  47.74 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  48.82 
 
 
408 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 
411 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
410 aa  178  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 
372 aa  177  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 
398 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  49.03 
 
 
327 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 
298 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 
298 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 
404 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 
405 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  48.57 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 
405 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 
405 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 
438 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
398 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 
297 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 
326 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
410 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.67 
 
 
413 aa  166  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
410 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 
298 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  44.76 
 
 
412 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 
309 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 
405 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 
326 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 
296 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  45.67 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  45.67 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.45 
 
 
429 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  44.29 
 
 
406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.45 
 
 
404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.97 
 
 
429 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  46.23 
 
 
400 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 
297 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 
289 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
297 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 
404 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  46.23 
 
 
400 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 
295 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.71 
 
 
432 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  45.19 
 
 
291 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
406 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  44.88 
 
 
296 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  43.58 
 
 
357 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 
322 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 
404 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  44.56 
 
 
317 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
400 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
404 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
415 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
404 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 
419 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  43.84 
 
 
328 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  46.67 
 
 
298 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  45.58 
 
 
297 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>