More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1314 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  68.79 
 
 		 875 aa  1188    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  69.94 
 
 		 861 aa  1189    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  69.82 
 
 		 861 aa  1189    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  66.98 
 
 		 890 aa  1124    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  53.85 
 
 		 896 aa  891    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  68.15 
 
 		 857 aa  1188    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  69.94 
 
 		 856 aa  1230    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  68.46 
 
 		 855 aa  1149    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  70.53 
 
 		 855 aa  1170    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  71.58 
 
 		 862 aa  1163    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  66.04 
 
 		 856 aa  1138    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  69.42 
 
 		 865 aa  1175    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  46.66 
 
 		 871 aa  719    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 858 aa  1749    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  69 
 
 		 861 aa  1171    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  69.25 
 
 		 872 aa  1103    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  70.11 
 
 		 856 aa  1194    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  63.63 
 
 		 856 aa  1084    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  70.53 
 
 		 855 aa  1170    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  70.22 
 
 		 855 aa  1156    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  42.42 
 
 		 878 aa  635  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  42.76 
 
 		 883 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  41.87 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  41.87 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.66 
 
 		 894 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.26 
 
 		 906 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.37 
 
 		 894 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  42.25 
 
 		 918 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  40.43 
 
 		 895 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  39.38 
 
 		 887 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  38.78 
 
 		 876 aa  591  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.75 
 
 		 902 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  40.46 
 
 		 901 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.09 
 
 		 882 aa  561  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  40 
 
 		 914 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  40.23 
 
 		 877 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  40.34 
 
 		 877 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  38.22 
 
 		 910 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.29 
 
 		 908 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.08 
 
 		 881 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.05 
 
 		 879 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  38.15 
 
 		 893 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  39.77 
 
 		 900 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.24 
 
 		 879 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.07 
 
 		 885 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  37.32 
 
 		 939 aa  519  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  42.21 
 
 		 746 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  42.14 
 
 		 751 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.64 
 
 		 874 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.75 
 
 		 874 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  43.3 
 
 		 755 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  39.4 
 
 		 730 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  39.45 
 
 		 741 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  41.92 
 
 		 722 aa  476  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  38.35 
 
 		 727 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  39.48 
 
 		 743 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  37.78 
 
 		 730 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  40.27 
 
 		 748 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  39.25 
 
 		 723 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  37.64 
 
 		 723 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  37.57 
 
 		 727 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  38.04 
 
 		 744 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  33.26 
 
 		 646 aa  225  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  37.28 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  28.25 
 
 		 622 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.6 
 
 		 741 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.06 
 
 		 778 aa  207  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.85 
 
 		 573 aa  206  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.76 
 
 		 778 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  32.54 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  29.93 
 
 		 636 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  30.12 
 
 		 637 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  32.58 
 
 		 664 aa  197  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  29.3 
 
 		 560 aa  187  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.75 
 
 		 328 aa  183  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  38.01 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.84 
 
 		 647 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  37.36 
 
 		 757 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.06 
 
 		 755 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.32 
 
 		 755 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.74 
 
 		 593 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.49 
 
 		 584 aa  165  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  37.5 
 
 		 569 aa  162  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  32.39 
 
 		 579 aa  161  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.19 
 
 		 754 aa  160  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  33.18 
 
 		 1103 aa  160  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 		 594 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 		 594 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 		 594 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  33.23 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  38.01 
 
 		 593 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  36.63 
 
 		 578 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  30.24 
 
 		 427 aa  154  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  27.13 
 
 		 1086 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  36.36 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  33.54 
 
 		 581 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.33 
 
 		 750 aa  152  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  33.55 
 
 		 597 aa  152  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  37.73 
 
 		 588 aa  152  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  32.28 
 
 		 585 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>