More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1304 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  78.49 
 
 		 295 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.09 
 
 		 295 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.74 
 
 		 275 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.1 
 
 		 291 aa  394  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  74.73 
 
 		 275 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.61 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  69.88 
 
 		 266 aa  332  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.25 
 
 		 273 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  37.08 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.31 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.24 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.31 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  40.65 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.65 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  35.9 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.5 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.34 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.44 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.49 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.33 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.25 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  42.98 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.43 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.25 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.49 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.06 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.43 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.56 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.32 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  41.13 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.45 
 
 		 333 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.09 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.46 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  37.45 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  37.45 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.36 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  39.59 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.27 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.68 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.68 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.87 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.06 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  40.17 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  41.67 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.53 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.54 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.46 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  41.7 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  41.7 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.87 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  39.39 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  39.39 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  37.65 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.66 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  38.1 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.1 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.04 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  37.66 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.66 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  36.18 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  37.55 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.65 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.66 
 
 		 277 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.41 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.63 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  36.18 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.93 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  41.53 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  40.71 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  37.07 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 		 519 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  32.45 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.59 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  29.8 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  40.09 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.4 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  40.09 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.4 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.49 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>