More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1288 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1342 aa  1869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.64 
 
 
1340 aa  1853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  65.23 
 
 
1308 aa  1667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  68.57 
 
 
1345 aa  1871    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  57.04 
 
 
1280 aa  1510    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  67.48 
 
 
1364 aa  1873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.34 
 
 
1289 aa  1491    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1342 aa  1868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  35.54 
 
 
1212 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  63.48 
 
 
1291 aa  1649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  69.12 
 
 
1324 aa  1889    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.29 
 
 
1309 aa  2110    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  63.59 
 
 
1259 aa  1653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  78.23 
 
 
1308 aa  2080    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1342 aa  1869    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  68.64 
 
 
1342 aa  1866    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1342 aa  1868    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  68.54 
 
 
1279 aa  1812    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  69.07 
 
 
1341 aa  1856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  35.76 
 
 
1217 aa  716    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.55 
 
 
1214 aa  755    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.15 
 
 
1265 aa  2197    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.2 
 
 
1341 aa  1863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.32 
 
 
1304 aa  2177    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  82.66 
 
 
1292 aa  2219    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.57 
 
 
1286 aa  1409    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.17 
 
 
1344 aa  1864    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1342 aa  1868    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1359 aa  1860    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  68.79 
 
 
1342 aa  1868    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  35.9 
 
 
1213 aa  707    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  77.75 
 
 
1307 aa  2088    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
1218 aa  728    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 
1212 aa  704    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.02 
 
 
1304 aa  2196    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
1307 aa  2702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  36.75 
 
 
1210 aa  719    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  61.67 
 
 
1271 aa  1615    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  83.3 
 
 
1300 aa  2254    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  68.06 
 
 
1349 aa  1872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.19 
 
 
1227 aa  721    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.91 
 
 
1292 aa  2074    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  69.05 
 
 
1324 aa  1892    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.54 
 
 
1279 aa  1815    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  37.13 
 
 
1221 aa  753    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  54.87 
 
 
1277 aa  1365    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  69.2 
 
 
1341 aa  1863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  77.6 
 
 
1307 aa  2086    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  63.64 
 
 
1292 aa  1659    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  68.37 
 
 
1345 aa  1867    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  68.52 
 
 
1345 aa  1871    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.4 
 
 
1288 aa  1484    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 
1202 aa  745    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.74 
 
 
1340 aa  1856    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  54.87 
 
 
1277 aa  1365    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.2 
 
 
1341 aa  1863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.55 
 
 
1282 aa  1343    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 
1218 aa  765    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.07 
 
 
1371 aa  1844    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
1197 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  31.32 
 
 
1188 aa  492  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  30.87 
 
 
1183 aa  493  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  32.27 
 
 
1204 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.88 
 
 
1187 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  29.71 
 
 
1183 aa  476  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.33 
 
 
459 aa  120  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.15 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.22 
 
 
460 aa  108  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.42 
 
 
469 aa  108  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.38 
 
 
460 aa  108  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.38 
 
 
460 aa  108  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.08 
 
 
456 aa  105  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  24.21 
 
 
461 aa  104  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  26.08 
 
 
473 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  26.14 
 
 
473 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
473 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  22.37 
 
 
430 aa  102  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.99 
 
 
460 aa  102  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.13 
 
 
472 aa  101  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.08 
 
 
473 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.68 
 
 
418 aa  100  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  26.07 
 
 
472 aa  100  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  25.81 
 
 
472 aa  100  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.43 
 
 
423 aa  99.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.15 
 
 
493 aa  99.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  98.2  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 
473 aa  98.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.94 
 
 
473 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  96.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  96.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  96.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  96.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  96.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.32 
 
 
479 aa  96.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  24.31 
 
 
428 aa  96.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.86 
 
 
411 aa  95.5  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  25.73 
 
 
485 aa  95.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.87 
 
 
432 aa  95.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  26.32 
 
 
524 aa  95.1  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  26.32 
 
 
473 aa  95.1  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>