More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1270 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  100 
 
 
355 aa  724    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  86.55 
 
 
362 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  87.75 
 
 
357 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  87.46 
 
 
379 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  86.08 
 
 
361 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  85.71 
 
 
364 aa  591  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  85.14 
 
 
371 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  87.01 
 
 
357 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  78.77 
 
 
363 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  79.2 
 
 
370 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  74.65 
 
 
369 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  71.77 
 
 
366 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  71.69 
 
 
365 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  68.27 
 
 
364 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  68.56 
 
 
364 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  71.69 
 
 
365 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  67.45 
 
 
370 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  67.16 
 
 
370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  66.57 
 
 
373 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  67.16 
 
 
373 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  66.28 
 
 
372 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  66.48 
 
 
362 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  65.55 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  65.99 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  66.38 
 
 
370 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  66.1 
 
 
370 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  67.45 
 
 
370 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  67.45 
 
 
370 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  67.45 
 
 
370 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  67.74 
 
 
369 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  63.05 
 
 
353 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  60.56 
 
 
354 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  62.94 
 
 
397 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  58.36 
 
 
341 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  58.06 
 
 
341 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  62.21 
 
 
363 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  59.47 
 
 
347 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  63.96 
 
 
350 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  58.08 
 
 
408 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  58.08 
 
 
408 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  58.89 
 
 
407 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  59.65 
 
 
406 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  60.12 
 
 
405 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  58.08 
 
 
408 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  58.08 
 
 
408 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  56.15 
 
 
358 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  58.33 
 
 
406 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  59.28 
 
 
407 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  58.69 
 
 
406 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  56.69 
 
 
345 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  58.98 
 
 
407 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  54.65 
 
 
395 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.23 
 
 
356 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  56.25 
 
 
397 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  57.27 
 
 
346 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  54.19 
 
 
345 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  55.37 
 
 
389 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  58.09 
 
 
387 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  52.69 
 
 
357 aa  352  7e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0268  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.6 
 
 
375 aa  350  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  57.61 
 
 
392 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  57.96 
 
 
397 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  60 
 
 
386 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.67 
 
 
396 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  52.26 
 
 
357 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  55.59 
 
 
386 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  56.53 
 
 
391 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  55.27 
 
 
390 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  55.27 
 
 
390 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  55.27 
 
 
390 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  55.13 
 
 
392 aa  342  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  56.7 
 
 
390 aa  342  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  55.84 
 
 
390 aa  342  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  58.21 
 
 
388 aa  342  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  56.27 
 
 
350 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  56.31 
 
 
405 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  56 
 
 
405 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1038  GTPase ObgE  58.03 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000432526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1071  GTPase ObgE  58.03 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00003897  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3321  GTPase ObgE  58.03 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000481857  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0969  GTPase ObgE  58.03 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00013573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  51.86 
 
 
402 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  55.84 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  55.52 
 
 
392 aa  335  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  55.83 
 
 
402 aa  335  7.999999999999999e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0981  GTPase ObgE  58.31 
 
 
388 aa  335  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00015516  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  54.28 
 
 
339 aa  335  9e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  55.08 
 
 
395 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  53.56 
 
 
392 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  53.85 
 
 
390 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  53.98 
 
 
339 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  53.85 
 
 
390 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  53.85 
 
 
390 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  53.85 
 
 
390 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>