More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1256 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  38.32 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.51 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.31 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 672 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 398 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 		 235 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 597 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.62 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 333 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 390 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.36 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 581 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.47 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  30.13 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 1035 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 367 aa  99.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.55 
 
 		 341 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 		 390 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  31.2 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 663 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 336 aa  95.5  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.94 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  29.82 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 		 746 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.17 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 358 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  45.19 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 365 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 342 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 386 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 573 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 327 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  27.08 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 380 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 727 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.8 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>