24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1236 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  53.54 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  53.54 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  53 
 
 		 105 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 106 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  48.54 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  48.08 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  37.63 
 
 		 691 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  40 
 
 		 690 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  32.04 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  34.15 
 
 		 191 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  29.89 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  32.29 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  34.57 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>