33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1146 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  892    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  63.15 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  61.4 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  52.63 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  50.93 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  50.93 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  48.85 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  45.96 
 
 		 560 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  45.75 
 
 		 525 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  46.15 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  45.52 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  48.64 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  45.18 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  44.35 
 
 		 505 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  36.18 
 
 		 929 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  35.96 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  35.58 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  32.18 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  33.9 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  30.66 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  30 
 
 		 459 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  30.53 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  30.47 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  31.49 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.07 
 
 		 1967 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  29.35 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  27.63 
 
 		 441 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  29.61 
 
 		 733 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  28.44 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  28.22 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  25.84 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  28.3 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  29.5 
 
 		 412 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>