More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1132 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  190  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  94.79 
 
 
96 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  93.75 
 
 
96 aa  178  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  89.58 
 
 
96 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  88.54 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  88.54 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  88.54 
 
 
96 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  87.5 
 
 
96 aa  167  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  85.42 
 
 
96 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  85.42 
 
 
96 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  84.38 
 
 
96 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
96 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
96 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
96 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
96 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
96 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  78.95 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 
97 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 
97 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  77.66 
 
 
97 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
96 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  72.92 
 
 
96 aa  147  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  73.68 
 
 
96 aa  147  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
97 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
97 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
97 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  141  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
96 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 
96 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 
96 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
96 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
96 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
96 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
127 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  68.42 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  68.42 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1939  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
104 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
95 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
96 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 
104 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
105 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
98 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 
98 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  64.58 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>