More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1126 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  100 
 
 		 315 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  82.22 
 
 		 315 aa  540  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  78.1 
 
 		 316 aa  510  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  78.1 
 
 		 316 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0654  transaldolase B  80 
 
 		 315 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.0202899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1779  transaldolase B  77.14 
 
 		 316 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  76.6 
 
 		 317 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  75.24 
 
 		 315 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  74.44 
 
 		 318 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  72.93 
 
 		 315 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  69.33 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4350  transaldolase B  67.31 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  66.03 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  64.74 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  64.42 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  63.26 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  63.26 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  63.67 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3318  transaldolase B  63.43 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0830908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0942  transaldolase B  63.02 
 
 		 317 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0291755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5677  transaldolase B  63.11 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0962  transaldolase B  63.11 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1013  transaldolase B  62.06 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.930396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0852  transaldolase B  62.06 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1940  transaldolase B  62.06 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1326  transaldolase B  62.38 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1174  transaldolase B  62.38 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  61.74 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1723  transaldolase B  62.46 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2254  transaldolase B  62.14 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0296  transaldolase B  62.06 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2335  transaldolase B  62.46 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1166  transaldolase B  62.38 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2358  transaldolase B  62.14 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1265  transaldolase B  60.95 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.785654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2374  transaldolase B  62.14 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0685  transaldolase B  60.06 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.947987  normal  0.786497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  59.94 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  60.7 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  59.55 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.86 
 
 		 392 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.19 
 
 		 397 aa  346  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  56.15 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  59.24 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  58.65 
 
 		 308 aa  341  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  59.24 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  59.81 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  54.52 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  56.92 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  58.65 
 
 		 308 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  58.33 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  55.56 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  55.84 
 
 		 319 aa  334  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  55.21 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  53.58 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  53.58 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  54.04 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  60.77 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  52.35 
 
 		 318 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  53.75 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  53.11 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  53.75 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  53.94 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  54.89 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  56.35 
 
 		 316 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  53.44 
 
 		 317 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  53.31 
 
 		 318 aa  328  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  52.8 
 
 		 318 aa  328  7e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  55.21 
 
 		 316 aa  328  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  55.77 
 
 		 310 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  52.8 
 
 		 318 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  52.8 
 
 		 318 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  54.21 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  53.31 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  54.31 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74289  transaldolase  57.41 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.318947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  53.31 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  53.31 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  53.31 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  53 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  52.68 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  52.68 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  52.66 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  53.31 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  56.56 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  55.35 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  52.35 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  56.56 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  53.63 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  52.68 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  54.35 
 
 		 316 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  52.35 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  53.63 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  52.35 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>