More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1010 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  56.54 
 
 
288 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  56.63 
 
 
288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  52.7 
 
 
296 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.39 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  51.01 
 
 
296 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  49.67 
 
 
301 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  46.1 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  47 
 
 
294 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.56 
 
 
297 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  44.9 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 
289 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.77 
 
 
282 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  46.64 
 
 
291 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  43.96 
 
 
295 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  42.27 
 
 
307 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  45.05 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  41.01 
 
 
291 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.49 
 
 
290 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  40.43 
 
 
285 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  40.43 
 
 
285 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  40.43 
 
 
285 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
257 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  35.03 
 
 
291 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
269 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
271 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
271 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
271 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.56 
 
 
263 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
270 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
275 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3692  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.69 
 
 
179 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
263 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.04 
 
 
270 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
266 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.69 
 
 
274 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
264 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.05 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
275 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.14 
 
 
261 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
267 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  33.57 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
276 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
281 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
260 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
281 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.36 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.64 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 
261 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
258 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.86 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
269 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.64 
 
 
263 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 
263 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
263 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  32.36 
 
 
282 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 
263 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
262 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
279 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.99 
 
 
263 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
264 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
287 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.57 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.22 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.46 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
263 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>