More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0916 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  340  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  56.08 
 
 		 154 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  54.49 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  48.37 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  49.66 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  44.52 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  43.84 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  42.58 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  41.06 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  43.62 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  42.58 
 
 		 151 aa  97.4  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  37.75 
 
 		 148 aa  97.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  38.71 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  39.74 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  41.61 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  39.33 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  39.33 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  42.28 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  39.1 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  40.91 
 
 		 151 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  40.91 
 
 		 151 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  38.67 
 
 		 161 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  40.4 
 
 		 155 aa  94.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  42.58 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  42.58 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  39.74 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  39.74 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  39.74 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  39.74 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  39.07 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  39.74 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  39.74 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  41.29 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  41.29 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 162 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 148 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  41.5 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 158 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.62 
 
 		 290 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  38.71 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  39.73 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.73 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.31 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  35.76 
 
 		 152 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.33 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 148 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  40.67 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  39.04 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  39.1 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.71 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.3 
 
 		 286 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  40.14 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  40.88 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.53 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  39.1 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  39.1 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  40.27 
 
 		 144 aa  84.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  39.1 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  39.1 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  39.1 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  34.44 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.67 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  38.93 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.26 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  43.59 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34.62 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.81 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  34.46 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  34.23 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  36.49 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.27 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.27 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  38.22 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  38.26 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.47 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.73 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.33 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>