58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0873 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5731  hypothetical protein  83.12 
 
 		 249 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2168  hypothetical protein  73.55 
 
 		 239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.202836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3744  protein of unknown function DUF969  69.51 
 
 		 249 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.79738  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0192  hypothetical protein  73.25 
 
 		 249 aa  340  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2906  hypothetical protein  74.12 
 
 		 254 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2371  protein of unknown function DUF969  75.34 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1601  normal  0.836703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1971  protein of unknown function DUF969  75.34 
 
 		 241 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0446  hypothetical protein  72.37 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2114  hypothetical protein  72.37 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0090  hypothetical protein  74.01 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3371  hypothetical protein  72.37 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0263  hypothetical protein  72.37 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0250  hypothetical protein  72.37 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2977  hypothetical protein  72.37 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.226934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0065  hypothetical protein  70.25 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1217  hypothetical protein  65.96 
 
 		 239 aa  318  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414254  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0227  hypothetical protein  73.21 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0005  hypothetical protein  67.26 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1258  hypothetical protein  67.8 
 
 		 243 aa  309  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0785505  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1118  hypothetical protein  65.45 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3592  hypothetical protein  65.45 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1170  hypothetical protein  65.45 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000118885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3291  protein of unknown function DUF969  65.18 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6525  protein of unknown function DUF969  54.31 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1182  protein of unknown function DUF969  50.66 
 
 		 239 aa  238  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0020  hypothetical protein  50.65 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2570  protein of unknown function DUF969  50.45 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4532  hypothetical protein  50.92 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3959  hypothetical protein  50.93 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2013  hypothetical protein  50.93 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319899  normal  0.403491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3452  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.159434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3466  hypothetical protein  50.93 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4307  hypothetical protein  50.93 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4059  hypothetical protein  50.93 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0933  hypothetical protein  50.23 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1378  hypothetical protein  44.59 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0656  hypothetical protein  43.95 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0577  hypothetical protein  43.95 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3118  hypothetical protein  44.25 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2846  permease  43.81 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3099  hypothetical protein  43.48 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3117  hypothetical protein  43.81 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3094  hypothetical protein  44.39 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2879  hypothetical protein  44.39 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.225033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2807  permease  44.39 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2871  hypothetical protein  43.36 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3085  hypothetical protein  43.75 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2151  hypothetical protein  44.09 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2480  hypothetical protein  50.47 
 
 		 217 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2881  protein of unknown function DUF969  50.52 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0437  protein of unknown function DUF969  41.06 
 
 		 223 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000406355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1372  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.157148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1834  hypothetical protein  38.05 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.320572 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0177  hypothetical protein  36.41 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000813125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1415  hypothetical protein  35.24 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0773605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1680  hypothetical protein  35.24 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.936458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1237  protein of unknown function DUF969  33 
 
 		 221 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>