More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0869 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  62.55 
 
 		 534 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  69.33 
 
 		 539 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  70.37 
 
 		 553 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1096    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  67.91 
 
 		 531 aa  703    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  60.29 
 
 		 539 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  60 
 
 		 541 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  56.88 
 
 		 536 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  47.22 
 
 		 562 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  49.63 
 
 		 522 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  50.84 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  46.63 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  47.68 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.63 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  43.56 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  40.76 
 
 		 592 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  39.6 
 
 		 564 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  38.47 
 
 		 571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.32 
 
 		 290 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.59 
 
 		 549 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  47 
 
 		 308 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  33.98 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  54.46 
 
 		 203 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  45.37 
 
 		 312 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  44.97 
 
 		 288 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  48.44 
 
 		 293 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  56.65 
 
 		 203 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  49.31 
 
 		 298 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  51.33 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  44.85 
 
 		 286 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.18 
 
 		 285 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  49.44 
 
 		 311 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  49.5 
 
 		 204 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  48.97 
 
 		 285 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  45.64 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  45.64 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  45.64 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  32.63 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  43.81 
 
 		 298 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  45.24 
 
 		 282 aa  193  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  46.58 
 
 		 288 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  42.76 
 
 		 300 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  47.52 
 
 		 201 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  51.55 
 
 		 204 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  48.74 
 
 		 203 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  40.55 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  44.07 
 
 		 288 aa  183  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  46.77 
 
 		 205 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  43.84 
 
 		 282 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  41.99 
 
 		 314 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  46.34 
 
 		 235 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  41.77 
 
 		 248 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  47.94 
 
 		 209 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  46.27 
 
 		 212 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.64 
 
 		 353 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 		 221 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 		 221 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 		 221 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  46.15 
 
 		 233 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.71 
 
 		 348 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.71 
 
 		 349 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.93 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  39.39 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  45.15 
 
 		 203 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  39.25 
 
 		 355 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.11 
 
 		 328 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 		 307 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  34.12 
 
 		 322 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  38.51 
 
 		 354 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  31.82 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  33.78 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  41.04 
 
 		 218 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  44.5 
 
 		 200 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  33.22 
 
 		 306 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.58 
 
 		 310 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  43.72 
 
 		 229 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.24 
 
 		 310 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.76 
 
 		 350 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  35.08 
 
 		 350 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  38.46 
 
 		 339 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  38.76 
 
 		 309 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  37.04 
 
 		 310 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  36.99 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 		 354 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.08 
 
 		 350 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  34.55 
 
 		 334 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  35.25 
 
 		 310 aa  150  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35.25 
 
 		 310 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.25 
 
 		 310 aa  150  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35.25 
 
 		 310 aa  150  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  35.25 
 
 		 310 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  35.91 
 
 		 310 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.45 
 
 		 312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  35.91 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.23 
 
 		 365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  32.67 
 
 		 318 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.23 
 
 		 329 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.7 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  35.57 
 
 		 310 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>