More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0809 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  79.35 
 
 		 215 aa  307  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  69.4 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66.16 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  67.93 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  69.4 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  68.85 
 
 		 216 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  64.82 
 
 		 213 aa  264  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.87 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.87 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.74 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  53.27 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  58.7 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.27 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  53.76 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.26 
 
 		 201 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.31 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  48.48 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.63 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.02 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.02 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.63 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  52.15 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  49.25 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  50.77 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.76 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.01 
 
 		 232 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.09 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  50.82 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  50.82 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  50.82 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.97 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  50.27 
 
 		 203 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.91 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  51.09 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  50.27 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  52.69 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.77 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.25 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.91 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.83 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  50.83 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.65 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.9 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.03 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.95 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.81 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  41.58 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.9 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.2 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.36 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.78 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 		 199 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  42.86 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.56 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.9 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.19 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.19 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  42.42 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  42.42 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  41.71 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 199 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  41.92 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  38.92 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  41.41 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  42.31 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  42.31 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  41.41 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  42.31 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  42.31 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  42.31 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.19 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.19 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  41.79 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  40.8 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  41.09 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  42.71 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.15 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.4 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  40.4 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.55 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  40.4 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  40.4 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  39.8 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  40.4 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  39.8 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  37.57 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.97 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  39.9 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  40.4 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  37.93 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>