71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0797 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  54.2 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  47.18 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  43.17 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  46.1 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  45.45 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  41.73 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  45.45 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  42.54 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  41.5 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  44.74 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  44.74 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  44.74 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  45.11 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  39.72 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  37.4 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  36.99 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  39.13 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  40 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  28.66 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  50 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  35 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  32.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  45.61 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  50 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  45.61 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  50 
 
 		 722 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.17 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  45.83 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  34.15 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  39.62 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  44.68 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  30.65 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  32.84 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  37.25 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  51.02 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  31.46 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  44.44 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  30.16 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.26 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  44 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  37.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  29.41 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  37.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  42.11 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  37.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  37.25 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  42.11 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  42.11 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3943  TadE family protein  32.98 
 
 		 177 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  43.75 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.76 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  37.04 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  47.73 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2685  TadE family protein  35.61 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  30 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  45.1 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  30.43 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  42.55 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  35.59 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  28.57 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  42.55 
 
 		 177 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  40.82 
 
 		 168 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  42 
 
 		 165 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  42 
 
 		 161 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>