187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0775 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  61.54 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  57.71 
 
 		 220 aa  277  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  57.4 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  57.4 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  57.4 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  60 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  51.12 
 
 		 223 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  51.79 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  49.11 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  48.48 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  48.09 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  48.7 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  47.03 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.04 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.56 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  42.51 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  44.81 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  45.16 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  42.47 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  41.45 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  41.4 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  45.08 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.17 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  41.94 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  44.51 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  43.68 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.17 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.54 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.54 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  42.15 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  40.31 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  39.79 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  38.17 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  39.33 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.21 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  38.5 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.55 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  39.01 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  35.75 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  36.46 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  36.46 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.18 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  35.14 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  31.55 
 
 		 260 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  34.05 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.21 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.21 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  30.32 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.72 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  24.02 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.33 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  26.79 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  27.93 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  30.05 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.92 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.11 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  26.23 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>