More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0735 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  100 
 
 		 613 aa  1248    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  71.33 
 
 		 614 aa  884    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  72.89 
 
 		 610 aa  908    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  64.4 
 
 		 593 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  46.47 
 
 		 621 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  47.28 
 
 		 578 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  46.19 
 
 		 586 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  45.61 
 
 		 614 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  45.61 
 
 		 614 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  45.3 
 
 		 636 aa  512  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  45.97 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  47.5 
 
 		 575 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  46.62 
 
 		 614 aa  502  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  46.26 
 
 		 579 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  47.45 
 
 		 606 aa  492  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  45.63 
 
 		 589 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  45.64 
 
 		 583 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  46.07 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  44.8 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  45.3 
 
 		 589 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  45.63 
 
 		 589 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  44.85 
 
 		 589 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  45.63 
 
 		 589 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  45.75 
 
 		 583 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  44.85 
 
 		 589 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  45.75 
 
 		 592 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  42.58 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  43.36 
 
 		 590 aa  478  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  46.71 
 
 		 588 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  44.68 
 
 		 589 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  44.2 
 
 		 587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.2 
 
 		 587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.5 
 
 		 588 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.5 
 
 		 588 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.5 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.5 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 588 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  41.1 
 
 		 596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  44.97 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  41.83 
 
 		 704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  41.5 
 
 		 712 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  41.5 
 
 		 704 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  43.42 
 
 		 708 aa  439  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  40.86 
 
 		 701 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  40.55 
 
 		 713 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  41.34 
 
 		 596 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  39.69 
 
 		 712 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  40.51 
 
 		 606 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  40.31 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  40.94 
 
 		 605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  40.31 
 
 		 602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  41.01 
 
 		 615 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.3 
 
 		 598 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  38.73 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  41 
 
 		 597 aa  392  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.63 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.78 
 
 		 595 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  36.67 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  36.52 
 
 		 635 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  36.05 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  34.99 
 
 		 634 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  34.99 
 
 		 636 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  34.99 
 
 		 636 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.09 
 
 		 651 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  35.45 
 
 		 557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  34.53 
 
 		 674 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  37.65 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  35.27 
 
 		 591 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  35.02 
 
 		 642 aa  339  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  35.15 
 
 		 666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  34.54 
 
 		 660 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  35.69 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  33.99 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  33.99 
 
 		 561 aa  337  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 561 aa  336  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  33.81 
 
 		 561 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  33.81 
 
 		 561 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  38.86 
 
 		 560 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.12 
 
 		 561 aa  332  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  36.65 
 
 		 629 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 639 aa  330  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  35.24 
 
 		 626 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  34.06 
 
 		 621 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  33.84 
 
 		 609 aa  321  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  33.88 
 
 		 621 aa  319  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  36.08 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  33.77 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  33.33 
 
 		 623 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  34.64 
 
 		 603 aa  309  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  33.56 
 
 		 633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  36.18 
 
 		 576 aa  306  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  30.96 
 
 		 616 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  33.94 
 
 		 667 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>