More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0729 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 304 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  81.91 
 
 		 304 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  70.47 
 
 		 312 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  73.87 
 
 		 296 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  64.29 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  64.29 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  67.47 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  64.51 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  62.46 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  52.13 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  52 
 
 		 320 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  46.32 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  47.16 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  45.96 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  47.16 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  44.79 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 		 305 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  46.24 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  45.96 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  46.29 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  43.16 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  43.94 
 
 		 302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  42.14 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  45.14 
 
 		 328 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  40.7 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  40.49 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  39.37 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 295 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  41.31 
 
 		 346 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 306 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  40.93 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  40.57 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  40.57 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  38.73 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.32 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  35.32 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  34.2 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  39.36 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  30.14 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  34.73 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.71 
 
 		 307 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  32.73 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.91 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  26.67 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  32.34 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  29.96 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  31.9 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.59 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  29.59 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  29.59 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  29.59 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  29.68 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.18 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  28.47 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.16 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  29.56 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>