264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0716 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  71.1 
 
 
432 aa  658  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 
431 aa  889  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  75.41 
 
 
431 aa  697  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  74.25 
 
 
431 aa  682  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.35 
 
 
437 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.17 
 
 
437 aa  470  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.64 
 
 
437 aa  468  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.4 
 
 
437 aa  466  1e-130  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.77 
 
 
441 aa  461  1e-128  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  2.20967e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.23 
 
 
437 aa  451  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.32 
 
 
428 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  43.1 
 
 
431 aa  391  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.82871e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.36 
 
 
441 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.72 
 
 
453 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.97 
 
 
432 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.72 
 
 
455 aa  353  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.37 
 
 
645 aa  353  3e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.43 
 
 
617 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40 
 
 
434 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.29 
 
 
431 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  41.46 
 
 
615 aa  346  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  40.84 
 
 
431 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  39.57 
 
 
431 aa  344  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.14 
 
 
431 aa  343  3e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.54 
 
 
627 aa  342  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.73 
 
 
611 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.72 
 
 
616 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.25 
 
 
616 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.14 
 
 
623 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.07125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.68 
 
 
430 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.23 
 
 
443 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.98 
 
 
449 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.68 
 
 
449 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.73 
 
 
428 aa  327  2e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.24 
 
 
428 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.61 
 
 
430 aa  326  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.73 
 
 
428 aa  325  8e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.1 
 
 
428 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.76 
 
 
428 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.35 
 
 
614 aa  323  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.65 
 
 
432 aa  323  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.55 
 
 
428 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.15 
 
 
430 aa  321  1e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.42 
 
 
428 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.67 
 
 
445 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.17 
 
 
634 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.78 
 
 
428 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.53 
 
 
636 aa  319  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.44 
 
 
445 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.78 
 
 
428 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.78 
 
 
428 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.53 
 
 
428 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.8 
 
 
424 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.74 
 
 
428 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.04 
 
 
424 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.58 
 
 
433 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.8 
 
 
424 aa  315  1e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.17 
 
 
427 aa  315  1e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  38.37 
 
 
622 aa  315  1e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.54 
 
 
428 aa  312  8e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.5 
 
 
437 aa  309  7e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.59 
 
 
424 aa  309  7e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.96 
 
 
444 aa  308  1e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  37.88 
 
 
432 aa  308  1e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  8.18274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.65 
 
 
429 aa  306  4e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.1 
 
 
428 aa  306  4e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.72 
 
 
440 aa  306  4e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.72 
 
 
440 aa  306  5e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.5 
 
 
440 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.21 
 
 
442 aa  305  1e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.01 
 
 
479 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.11 
 
 
430 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.71 
 
 
407 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.29 
 
 
446 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.4 
 
 
443 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.4 
 
 
443 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.4 
 
 
443 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.92 
 
 
420 aa  292  7e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.4 
 
 
445 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.27 
 
 
447 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.18 
 
 
443 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.96 
 
 
443 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.96 
 
 
443 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.99 
 
 
446 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  36.82 
 
 
447 aa  289  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  36.38 
 
 
438 aa  287  3e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  37.07 
 
 
449 aa  286  6e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.35 
 
 
441 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.35 
 
 
441 aa  285  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.35 
 
 
441 aa  285  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.35 
 
 
441 aa  285  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1932  hypothetical protein  35.91 
 
 
447 aa  284  3e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.32 
 
 
447 aa  283  5e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.1 
 
 
446 aa  282  7e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.7 
 
 
447 aa  282  8e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0577  4-hydroxybutyrate CoA transferase (cat2-1)  37.3 
 
 
444 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537722  hitchhiker  0.000215809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.61 
 
 
445 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.61 
 
 
446 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.56 
 
 
432 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0382  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.85 
 
 
448 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>