More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0705 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  53.39 
 
 		 923 aa  884    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 924 aa  1823    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  35.79 
 
 		 929 aa  485  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 931 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 927 aa  372  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 934 aa  292  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 952 aa  225  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.41 
 
 		 935 aa  204  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 944 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 955 aa  173  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 883 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.75 
 
 		 924 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  23.93 
 
 		 918 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 900 aa  135  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  25 
 
 		 933 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  23.26 
 
 		 892 aa  128  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 886 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  24.7 
 
 		 917 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  23.25 
 
 		 924 aa  121  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  22.29 
 
 		 914 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  21.92 
 
 		 937 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  22.04 
 
 		 924 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.51 
 
 		 884 aa  108  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 860 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  23.12 
 
 		 931 aa  104  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 884 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 917 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.09 
 
 		 887 aa  98.2  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.14 
 
 		 883 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 864 aa  96.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.37 
 
 		 882 aa  94  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 729 aa  92.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  28.74 
 
 		 939 aa  92.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 1737 aa  92  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 873 aa  90.9  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.94 
 
 		 882 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.98 
 
 		 729 aa  89.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 878 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 		 1694 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.54 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 767 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1676 aa  81.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 567 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 643 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 582 aa  78.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.5 
 
 		 2240 aa  78.2  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.03 
 
 		 725 aa  78.2  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 2262 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.98 
 
 		 1056 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 594 aa  74.7  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 808 aa  74.7  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  24.17 
 
 		 880 aa  74.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 800 aa  73.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 4079 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.73 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.36 
 
 		 1022 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 		 3301 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 673 aa  70.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  19.11 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  20.39 
 
 		 880 aa  67  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.44 
 
 		 573 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.9 
 
 		 1979 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 886 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  24.6 
 
 		 656 aa  67  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 979 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 2262 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.63 
 
 		 1486 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  22.61 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  27.09 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  22.24 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.7 
 
 		 927 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.32 
 
 		 676 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 		 614 aa  63.9  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 827 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.29 
 
 		 758 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 		 3172 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.72 
 
 		 557 aa  63.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.75 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.74 
 
 		 988 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  19.38 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 313 aa  62  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.78 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.65 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 402 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 3560 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.58 
 
 		 832 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>