More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0687 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 325 aa  675    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  30.33 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.96 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 1032 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.05 
 
 		 466 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 544 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  31.86 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  31.72 
 
 		 1076 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 1250 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 663 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.19 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 727 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 847 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 581 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.33 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.9 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.04 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 		 363 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 247 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 386 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  29.34 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.33 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.02 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.89 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.52 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  24.55 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 672 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 353 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1411  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.49 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.28 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 1177 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 1177 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.44 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 703 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.83 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28 
 
 		 266 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>