More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0671 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  100 
 
 
619 aa  1258  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.61 
 
 
628 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.74 
 
 
638 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.19 
 
 
634 aa  418  1e-115  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.74 
 
 
632 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.24 
 
 
625 aa  401  1e-110  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.23 
 
 
634 aa  402  1e-110  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.77 
 
 
646 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  41.16 
 
 
643 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.05 
 
 
622 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.87 
 
 
641 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.79 
 
 
625 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.01 
 
 
629 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.34 
 
 
635 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.93 
 
 
629 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.5 
 
 
632 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.88023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.61 
 
 
639 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.89 
 
 
639 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.46 
 
 
629 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.54 
 
 
643 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.09 
 
 
635 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.21 
 
 
619 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.72 
 
 
634 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  40.07 
 
 
631 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  38.26 
 
 
642 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.5 
 
 
632 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.82 
 
 
647 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.51 
 
 
631 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.93 
 
 
633 aa  362  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  34.55 
 
 
630 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
637 aa  357  4e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36 
 
 
626 aa  357  4e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  35.26 
 
 
637 aa  357  5e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.78 
 
 
655 aa  356  7e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.77 
 
 
629 aa  356  8e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.84 
 
 
637 aa  354  3e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.665641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.1 
 
 
655 aa  353  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.91 
 
 
656 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.39 
 
 
641 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.57 
 
 
643 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  37.6 
 
 
606 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.9 
 
 
630 aa  350  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.07 
 
 
656 aa  350  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.07 
 
 
656 aa  350  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.07 
 
 
656 aa  350  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.85 
 
 
637 aa  349  7e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.07 
 
 
656 aa  349  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.07 
 
 
656 aa  349  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.07 
 
 
658 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.88 
 
 
656 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.46 
 
 
655 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.88 
 
 
656 aa  347  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.88 
 
 
656 aa  347  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.72 
 
 
655 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  37.18 
 
 
656 aa  346  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.89 
 
 
639 aa  346  8e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.31 
 
 
623 aa  345  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1953  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.94 
 
 
611 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  34.37 
 
 
629 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.3 
 
 
633 aa  343  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.28 
 
 
646 aa  341  3e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.9 
 
 
633 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.97095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5373  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.95 
 
 
676 aa  340  6e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  7.47097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.26358e-07  unclonable  6.28543e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.74005e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.60892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.26 
 
 
649 aa  337  3e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.00713e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.17 
 
 
633 aa  337  3e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.55 
 
 
633 aa  337  4e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.33092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.91 
 
 
656 aa  336  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.86 
 
 
651 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.33 
 
 
605 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.28708e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.95 
 
 
592 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.18 
 
 
643 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.62 
 
 
595 aa  335  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2121  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
653 aa  333  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.973734  normal  0.744167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1548  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.07 
 
 
647 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545574  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.86 
 
 
665 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  2.06838e-05 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.41 
 
 
635 aa  332  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.85 
 
 
650 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.34 
 
 
656 aa  329  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3228  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.28 
 
 
653 aa  328  2e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2639  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.09 
 
 
647 aa  326  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.73 
 
 
664 aa  326  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3317  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.99 
 
 
629 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2478  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.31 
 
 
660 aa  325  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.669542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  37.07 
 
 
590 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34 
 
 
649 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  1.22454e-06  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0146  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.81 
 
 
652 aa  323  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.74 
 
 
610 aa  321  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.23 
 
 
654 aa  320  4e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.1 
 
 
627 aa  320  5e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.69 
 
 
593 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.84 
 
 
622 aa  318  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.08 
 
 
625 aa  317  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3421  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.55 
 
 
662 aa  317  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>