More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0642 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  60.31 
 
 		 663 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  60.31 
 
 		 636 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  59.2 
 
 		 649 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 648 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  60.47 
 
 		 636 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 648 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  55.42 
 
 		 646 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  69.83 
 
 		 641 aa  856    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  63.9 
 
 		 632 aa  749    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  62.19 
 
 		 642 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  59.35 
 
 		 661 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  70.77 
 
 		 628 aa  865    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 1065 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 648 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  58.07 
 
 		 641 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  71.25 
 
 		 628 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  59.13 
 
 		 649 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  74.09 
 
 		 635 aa  870    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  61.78 
 
 		 640 aa  742    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  70.25 
 
 		 626 aa  882    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  66.67 
 
 		 626 aa  783    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  55.94 
 
 		 640 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  58.94 
 
 		 648 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  58.54 
 
 		 648 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  61.26 
 
 		 634 aa  739    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 660 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  100 
 
 		 629 aa  1262    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  55.94 
 
 		 648 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  69.6 
 
 		 648 aa  858    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  59.56 
 
 		 645 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  59.81 
 
 		 688 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  60.62 
 
 		 641 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 660 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  69.73 
 
 		 629 aa  840    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  59.35 
 
 		 661 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  59.35 
 
 		 649 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 660 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  68.59 
 
 		 645 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  58.73 
 
 		 649 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  55 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  54.16 
 
 		 631 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 632 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.04 
 
 		 653 aa  558  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  46.78 
 
 		 640 aa  552  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  49.23 
 
 		 650 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  48.21 
 
 		 642 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  46.49 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 		 642 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  48.07 
 
 		 642 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  48.07 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  45.26 
 
 		 648 aa  535  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  45.11 
 
 		 648 aa  530  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  46.09 
 
 		 643 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  44.5 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  44.5 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  43.98 
 
 		 638 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  44.5 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  44.77 
 
 		 639 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  47.55 
 
 		 627 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  45.09 
 
 		 639 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  48.2 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  47.11 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  45.72 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 646 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  46.19 
 
 		 620 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  48.27 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  47.86 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 620 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  46.65 
 
 		 636 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  43.34 
 
 		 641 aa  515  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  44.75 
 
 		 649 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  45.62 
 
 		 641 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 632 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  43.12 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  42.95 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  44.46 
 
 		 635 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  42.81 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  42.83 
 
 		 647 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  42.95 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  42.95 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  42.97 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  42.97 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  42.95 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  46.46 
 
 		 623 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  43.99 
 
 		 635 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 637 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 639 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  48.43 
 
 		 639 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 633 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  43.89 
 
 		 645 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  43.96 
 
 		 639 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  48.5 
 
 		 623 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  44.62 
 
 		 634 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  48.37 
 
 		 641 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  44.31 
 
 		 635 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  44.62 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  44.46 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  43.81 
 
 		 638 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>