More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0574 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  100 
 
 
142 aa  289  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  70.71 
 
 
141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  71.01 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  65.94 
 
 
140 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  66.91 
 
 
141 aa  202  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  66.67 
 
 
140 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  68.12 
 
 
141 aa  200  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  68.84 
 
 
142 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  66.67 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  65.22 
 
 
141 aa  196  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  68.12 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  65.94 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  67.42 
 
 
142 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  66.67 
 
 
142 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  64.49 
 
 
141 aa  191  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  64.49 
 
 
141 aa  190  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  66.67 
 
 
141 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  62.41 
 
 
142 aa  190  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  62.14 
 
 
141 aa  190  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  68.84 
 
 
141 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  68.12 
 
 
141 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  65.22 
 
 
142 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  67.39 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  64.49 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  64.49 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  67.39 
 
 
141 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  65.15 
 
 
142 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  67.39 
 
 
141 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  62.41 
 
 
138 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  62.41 
 
 
138 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  65.15 
 
 
142 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  71.01 
 
 
141 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  64.93 
 
 
139 aa  183  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  66.67 
 
 
139 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  65.94 
 
 
141 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  61.59 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  61.7 
 
 
138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  65.15 
 
 
139 aa  180  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  67.39 
 
 
141 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  62.04 
 
 
142 aa  176  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  61.03 
 
 
141 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  64.23 
 
 
142 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  60.99 
 
 
142 aa  174  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  59.29 
 
 
142 aa  174  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  59.12 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  59.12 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  64.18 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  57.97 
 
 
140 aa  170  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  62.41 
 
 
142 aa  170  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  59.85 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  60.43 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  64.18 
 
 
141 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1196  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 
143 aa  167  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  63.04 
 
 
138 aa  167  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1104  OsmC family protein  59.85 
 
 
143 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  57.66 
 
 
139 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  57.66 
 
 
139 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  57.66 
 
 
139 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  57.66 
 
 
139 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  57.25 
 
 
139 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  56.52 
 
 
139 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  57.25 
 
 
139 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2305  organic hydroperoxide resistance protein  63.5 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  56.52 
 
 
139 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  56.52 
 
 
139 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  56.52 
 
 
139 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  57.25 
 
 
142 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  56.93 
 
 
141 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  56.52 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  56.52 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  53.28 
 
 
141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4428  OsmC family protein  56.03 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.49073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  55.8 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  55.8 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2206  OsmC-like protein  56.43 
 
 
150 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  55.07 
 
 
140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  54.35 
 
 
140 aa  157  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  52.9 
 
 
140 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2464  OsmC-like protein  51.06 
 
 
139 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  52.45 
 
 
139 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  56.2 
 
 
140 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  56.2 
 
 
140 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  56.2 
 
 
140 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  50.35 
 
 
149 aa  154  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  59.12 
 
 
141 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  52.17 
 
 
140 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2850  OsmC family protein  59.85 
 
 
141 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.77711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.8 
 
 
142 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1543  OsmC family protein  53.62 
 
 
139 aa  151  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.199318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  54.35 
 
 
140 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1675  OsmC family protein  51.05 
 
 
139 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110277  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1223  OsmC-like protein  51.05 
 
 
139 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2273  OsmC family protein  51.77 
 
 
138 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0726471  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1702  OsmC family protein  51.05 
 
 
139 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  52.17 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  51.39 
 
 
141 aa  150  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  53.62 
 
 
140 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7220  OsmC family protein  50.72 
 
 
138 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  58.39 
 
 
141 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5124  OsmC-like protein  50.71 
 
 
138 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>